La Fundación Theatro Municipal de São Paulo fue instituida por la Ley 15.380 el 27 de mayo de 2011 y reglamentada por el decreto nº 53.225, el 19 de junio. El Estatuto brinda un nuevo formato administrativo: una Fundación de Derecho Público vinculada a la Secretaría Municipal de Cultura, que presenta órganos de gerencia, Consejo Deliberativo y Consejo Fiscal en su estructura organizacional.

Con la Fundación, el TMSP pasa a tener autonomía en los campos administrativo, financiero, patrimonial y artístico – una conquista esencial para el desarrollo de un proyecto artístico de excelencia. Son de su responsabilidad institucional el mantenimiento del edificio histórico del Theatro, de la Praça das Artes y de la Central Técnica, la administración de las escuelas municipales de música y danza y algunos de los más importantes cuerpos artísticos del país: la Orquesta Sinfónica Municipal de São Paulo, el Ballet de la Ciudad de São Paulo, el Quarteto de Cordas de la Ciudad de São Paulo, el Coro Lírico Municipal de São Paulo y el Coral Paulistano. Para gestionar todas las actividades del Theatro, la Organización Social Instituto Odeon fue contratada por selección pública.

Los recursos que componen los ingresos de la Fundación provienen del presupuesto de la Municipalidad de São Paulo, de la venta de productos y servicios educativos y culturales, ingresos, convenios, donaciones, patrocinio, entre otras fuentes.

Bajo dirección general de Patricia Maria de Oliveira, tiene su Consejo Deliberativo presidido por el Secretario Municipal de Cultura y compuesto por miembros natos, por miembros indicados por el Secretario Municipal de Cultura, así como por miembros elegidos. El Consejo Fiscal está compuesto por miembros titulares y suplentes, indicados por la Secretaría Municipal de Finanzas, y miembros elegidos entre los servidores de la Fundación.